ائوزین B از مشتقات فلورسئین بوده و از نظر ساختار و کاربرد به ائوزین Y شباهت دارد، اما شدت و تون رنگی متفاوتی ایجاد میکند. این رنگ در بافتشناسی و میکروسکوپی برای رنگآمیزی سلولها و بافتها بهکار میرود و میتواند اجزای سلولی غنی از پروتئین را بهخوبی مشخص کند. در آزمایشگاههای تحقیقاتی و بیوشیمی، ائوزین B بهعنوان معرف رنگی، ردیاب و در برخی روشهای آنالیتیک و مطالعات فلورسانس استفاده میشود. همچنین در تحقیقات شیمیایی برای بررسی واکنشها و نشاندارسازی ترکیبات کاربرد دارد.